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動(dòng)物視頻跟蹤和行為分析系統(tǒng)

時(shí)間:2022-09-26

作者:易科泰

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簡介:

  動(dòng)物視頻跟蹤和行為分析系統(tǒng)由高分辨率高幀頻工業(yè)相機(jī)、專業(yè)動(dòng)物行為采集及分析軟件、紅外背光板等組成,無需標(biāo)記即可對(duì)魚類、昆蟲、哺乳動(dòng)物、鳥類的行為進(jìn)行分析。使用時(shí)可直接使用軟件錄制高質(zhì)量的動(dòng)物活動(dòng)視頻并對(duì)視頻中的目標(biāo)動(dòng)物進(jìn)行識(shí)別跟蹤,獲得目標(biāo)動(dòng)物的位置坐標(biāo)(X坐標(biāo)和Y坐標(biāo);單個(gè)動(dòng)物可做3D跟蹤,即包括XYZ坐標(biāo))及隨時(shí)間變化的活動(dòng)軌跡。系統(tǒng)可自動(dòng)計(jì)算個(gè)體、處理組、感興趣區(qū)域相關(guān)的20余種行為參數(shù),并可導(dǎo)出疊加分析數(shù)據(jù)的圖像和視頻以便于使用者進(jìn)行展示。

功能特點(diǎn)

  • 采用工業(yè)相機(jī),高分辨率、高幀頻、超高速傳輸
  • 可跟蹤和分析魚類、昆蟲、哺乳動(dòng)物、鳥類及更多
  • 基于對(duì)比度或者背景減除法發(fā)現(xiàn)目標(biāo),無需標(biāo)記物
  • 可跟蹤任意大小和形狀的區(qū)域,如迷宮、水箱、呼吸室
  • 對(duì)24孔板、48孔板、96孔板進(jìn)行高通量跟蹤和分析
  • 3D跟蹤,可導(dǎo)出3D坐標(biāo)和路徑
  • 可結(jié)合游泳儀、植入式動(dòng)物體溫心率數(shù)據(jù)采集器等設(shè)備使用

系統(tǒng)配置

  • 1彩色工業(yè)攝像機(jī)
  • 專業(yè)級(jí)定焦鏡頭
  • 專業(yè)動(dòng)物行為采集及分析軟件LoliTrack5
  • 紅外背光板:用于透明多孔板和透明魚缸等的底部照明,可消除反射,也可用于黑暗環(huán)境的視頻記錄
  • 動(dòng)物活動(dòng)室/池(選配):定制化水箱/魚缸、活動(dòng)室等

技術(shù)指標(biāo)

  • 可自動(dòng)計(jì)算參數(shù)包括:
  • 位置坐標(biāo)(包括前、后、中線中心、重心)
  • 移動(dòng)距離
  • 速度和速率(X方向、Y方向)
  • 加速度(X方向、Y方向)
  • 移動(dòng)方向
  • 身體取向
  • 身體彎曲
  • 轉(zhuǎn)彎速率
  • 移動(dòng)方向和身體取向變化速率
  • 活動(dòng)/非活動(dòng)時(shí)間和比例
  • 感興趣區(qū)域花費(fèi)時(shí)間和占比
  • 目標(biāo)動(dòng)物到感興趣區(qū)域的距離
  • 個(gè)體間距離(IID),包括平均、眾數(shù)和最小
  • 動(dòng)物行為觀測分析軟件具備多種基于反差法和背景減除法的過濾功能。
  • 軟件可跟蹤單個(gè)區(qū)域或多個(gè)區(qū)域內(nèi)的多個(gè)動(dòng)物,即使動(dòng)物具有相同(或不同)的形狀、顏色和大小。
  • 可挑選單個(gè)個(gè)體用以跟蹤和分析,而非所有的個(gè)體;可自定義跟蹤時(shí)長,忽略或者只跟蹤某段時(shí)間;具備批量分析功能。
  • 軟件可識(shí)別特定身體的點(diǎn)位(如尾、頭、中線中點(diǎn)、重心),跟蹤這些點(diǎn)用以研究運(yùn)動(dòng)學(xué)(如擺尾頻率、身體擺動(dòng)等)或者特定的行為(如身體取向、移動(dòng)方向等)。

  • 軟件具備頻率(心率、擺尾頻率等)計(jì)算和容積(心博量等)計(jì)算功能。

  • 軟件具備錯(cuò)誤自查功能,并提供手動(dòng)糾錯(cuò)的快捷方式。
  • 軟件兼容大部分相機(jī)和視頻格式,具備視頻記錄和編輯工具,具備位置、速度、加速度和轉(zhuǎn)彎速率的熱圖生成功能,并可輸出疊加了分析結(jié)果的視頻和圖片,用戶可自定義Excel數(shù)據(jù)文件輸出內(nèi)容。
  • 軟件能夠?qū)蓚€(gè)相機(jī)或者兩個(gè)視頻文件的目標(biāo)動(dòng)物進(jìn)行3D視頻跟蹤和行為分析,導(dǎo)出3D坐標(biāo)和軌跡的3D模型,在其他軟件做進(jìn)一步的可視化和分析。
  • 系統(tǒng)可對(duì)24、48或96孔板中的生物進(jìn)行跟蹤和分析,對(duì)其活動(dòng)水平或者運(yùn)動(dòng)進(jìn)行快速篩選評(píng)估(常見于毒理學(xué)或者生物醫(yī)學(xué)檢測)??奢斎胗脩糇远x的處理描述以幫助分析數(shù)據(jù)。

  • 1彩色高清高幀頻工業(yè)攝像機(jī):緊湊設(shè)計(jì),分辨率2592 x 1944 (5.04 MP),幀率48FPS,芯片尺寸1/2.5" (5.702 mm x 4.277 mm),重量33g。包括USB數(shù)據(jù)線、三腳架適配器、壁掛式支架安裝。
  • 專業(yè)級(jí)定焦鏡頭:6mm、8mm、12mm、16mm、25mm、50mm焦距可選。

  • 紅外背光板:大小16×16cm至56cm×56cm共6種尺寸可選,波長850nm。

應(yīng)用案例

高濃度人體可卡因代謝物苯甲酰愛康寧(BE)暴露使大型溞個(gè)體的活動(dòng)性顯著降低、游泳速率顯著增大 (Environmental Pollution, 2018)

漸凍癥斑馬魚模型表現(xiàn)出病癥早期階段異常行為增多、晚期階段運(yùn)動(dòng)活性降低的表型(Glia, 2019)

 

產(chǎn)地:歐洲

 

參考文獻(xiàn)

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